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生物质锅炉在燃料焚烧时烟气为高温烟气，烟气中没有二氧化硫，所以在选用锅炉布袋除尘器是只考滤高温的除尘器布袋就可以。由于生物质燃料在燃烧时烟气中带有火星，故需在布袋除尘器前面加装阻火器或旋风除尘器。
生物质锅炉布袋除尘器的烟气处理工艺：
生物质锅炉起燃时产生的烟气和正常燃烧时产生的烟气，根据锅炉的大小吨位设计加不加旁路系统。烟气粉尘由除尘管道进入旋风除尘器或者（阻火器），此时烟尘中的大颗粒在旋风除尘器的离心力的作用下进行分离，大颗粒粉尘由旋风除尘器沉降处理，细小颗粒粉尘由管道进入布袋除尘器。经高温布袋过滤，通过脉冲喷吹将粘附在布袋表面的粉尘进行沉降，集中在除尘器的分室灰斗内，利用自动除料控制器进行回收或利用。经布袋除尘器处理过后的净气通过风机由烟囱排入空气。经过布袋除尘器对锅炉含尘烟气的处理，可减小烟尘对周边环境的污染，达到清洁的生产目的。
含尘气体由导流管进去各单元室，经过导流装置作用下，较大比重粉尘分离后直接落入灰斗、其余粉尘随气流均匀进入各仓室过滤区，过滤后的洁净气体透过滤袋经上箱体、提升阀、排风管排出。随着过滤工况的进行，当滤袋表面积尘达到厚度时，由清灰控制装置(差压或定时、手动控制)按设定程序关闭提升阀，控制当前单元离线，并打开电磁脉冲阀喷吹，抖落滤袋上的粉尘。落入灰斗中的粉尘经由卸灰阀排出后，利用输灰系统送出。